Tổng cục Hải quan ngày 29-4-2008 cơ văn bản sóo 2003/TCHQ-GSQL yêu cầu các Cục Hải quan địa phương rà soát số lượng hợp đồng gia công, tờ khai nhập nguyên liệu để sản xuất hàng xuất khẩu còn tồn đọng theo các nguyên nhân và áp dụng các biện pháp xử lý theo hướng dẫn tại điểm 3 công văn số 7264/TCHQ-GSQL ngày 27-12-2007. Trên cơ sở rà soát số lượng tồn đọng, đánh giá khả năng giải quyết dứt điểm được bao nhiêu trường hợp trong năm 2008, còn bao nhiêu trường hợp không giải quyết được thì đề xuất phương án xử lý.
Đối với trường hợp tồn đọng kéo dài, khó có khả năng thanh khoản cần phải chuyển cho cơ quan Công an điều tra xử lý về tội trốn thuế, TCHQ yêu cầu các đơn vị chuẩn bị đầy đủ hồ sơ, chứng từ liên quan đến hợp đồng gia công, tờ khai nhập nguyên liệu để sản xuất hàng xuất khẩu còn tồn đọng, số thuế phải truy thu của từng hợp đồng, từng tờ khai để chuyển cho cơ quan Công an. Các đơn vị phải chủ động phối hợp với cơ quan Công an để cung cấp thông tin liên quan đến vụ việc trước và sau khi chuyển hồ sơ theo yêu cầu.