Tổng cục Hải quan cho biết, theo định hướng hiện đại hóa Hải quan đến năm 2010, tỷ lệ kiểm tra hàng hóa trong quá trình thông quan phải đạt mức dưới 10%; quy trình kiểm tra căn bản sẽ là kiểm tra sau thông quan (KTSTQ). Như vậy, sẽ có trên 90% hàng hóa xuất nhập khẩu không phải kiểm tra khi làm thủ tục hải quan.
Theo số liệu của ngành, với biên chế hiện tại, bình quân mỗi cán bộ KTSTQ phải quản lý khoảng 70 doanh nghiệp và phải tiếp nhận, nghiên cứu khoảng 6.000 bộ hồ sơ hải quan mỗi năm. Để thực hiện mục tiêu hiện đại hóa ngành, Tổng cục đã xây dựng hệ thống giải pháp nhằm chuẩn hóa quy trình KTSTQ... Nếu được thực hiện đúng lộ trình, quy trình quản lý của ngành sẽ chuyển hẳn từ tiền kiểm sang hậu kiểm, góp phần đẩy lùi tiêu cực và gian lận thương mại.