Thông tư 66 quy định, đối với khoản lệ phí cấp hộ chiếu, thị thực và các loại giấy tờ cho người Việt Nam và người nước ngoài nhập cảnh, xuất cảnh, quá cảnh và cư trú tại Việt Nam (gọi chung là lệ phí xuất nhập cảnh) do các cơ quan thuộc Bộ Ngoại giao, Bộ Công an và Bộ Quốc phòng tổ chức thu tại Việt Nam. Những trường hợp được miễn thu lệ phí quy định, cơ quan thu lệ phí phải đóng dấu “miễn thu lệ phí” (GRATIS) vào giấy tờ đã cấp. Trường hợp người việt Nam và người nước ngoài đã nộp lệ phí cấp hộ chiếu, giaýa tờ có liên quan gắn liền việc cấp hộ chiếu, giấy tờ đã cấp. Trường hợp người Việt Nam và người nước ngoài đã nộp lệ phí cấp hộ chiếu, giấy tờ có liên quan gắn liền việc capá hộ chiếu và thị thực nhưng không đủ điều kiện được cấp những giấy tờ này thì cơ quan thu lệ phí thực hiện hoàn trả số tiền lệ phí đã thực nộ khi có thông báo không đủ điều kiện được cấp bằng nguồn tiền thu lệ phí xuất nhập cảnh. Tiền lệ phí không được hoàn trả lại nếu đương sự từ chối không nhận kết quả xử lý hồ sơ.
Thông tư này có hiệu lực thi hành sau 45 ngày, kể từ ngày ký.