Sau khi đầu tư nâng cấp Cảng Đà Nẵng bằng nguồn vốn ODA của Nhật Bản và vốn tự bổ sung của Cảng, từ năm 2006, cùng với các bến tổng hợp, Cảng Đà Nẵng có thêm một bến container hiện đại nhất miền Trung, có hệ thống thiết bị bốc dỡ hiện đại, cầu tàu, kho bãi chuyên dùng, với chương trình quản lý Catos tiên tiến, đê chắn sóng kiên cố... đang phát huy tác dụng, thu hút các hãng tàu và các nhà xuất nhập khẩu trong và ngoài nước đưa tàu và hàng đến Cảng Đà Nẵng nhiều hơn.
Nhằm mục tiêu sản lượng hàng hoá container qua Cảng Đà Nẵng năm 2010 sẽ đạt 120.000TEUS, năm 2008 Cảng Đà Nẵng phấn đấu 65.000TEUS. Để đạt được các mục tiêu trên, về quản trị nội bộ, Cảng duy trì quản trị chất lượng theo ISO 9001-2000 với cam kết năng suất bốc xếp cao và ổn định, thủ tục giao nhận đơn giản, kịp thời; hoàn thiện các dịch vụ hỗ trợ cho tàu và khách hàng... Về công tác thị trường, Cảng có chiến lược thâm nhập thị trường truyền thống và mở rộng thị trường mới; khuyến khích các hãng tàu mở thêm tuyến; ủng hộ khách hàng vận tải bằng container; xây dựng các chính sách tiếp thị xem như là công cụ để thu hút khách hàng; tăng cường quảng bá hình ảnh Cảng Đà nẵng với khách hàng và cộng đồng... Trước mắt Cảng Đà Nẵng tạp trung hoàn thành mục tiêu sản lượng container quý 2/2008 là 14.500TEUS
Cảng Đà Nẵng tiếp tục đầu tư nhiều thiết bị phục vụ sản xuất, trong đó có một cẩu bờ có sức nâng 40 tấn tại bến 5 và 2 cần cẩu cố định có sức nâng 40 tấn, tầm với từ 3,5 đến 29,5m, dự kiến quý 3 năm 2008 sẽ đưa vào khai thác sử dụng tại bến 4 cảng Tiên Sa. Đây là những thiết bị chuyên dụng hiện đại phục vụ cho việc xếp dỡ hàng Container và hàng bách hóa tổng hợp, cảng Đà Nẵng phấn đấu đưa năng lực xếp dỡ Cảng Tiên Sa vượt 4,5 triệu tấn/năm.