Tại Điểm 5.1 Mục I, Phần B Thông tư số 60/2007/TT-BTC (14/6/2007) của Bộ Tài chính hướng dẫn: “Người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai sót, nhầm lẫn gây ảnh hưởng đến số thuế phải nộp thì được khai bổ sung hồ sơ khai thuế. Hồ sơ khai thuế bổ sung được nộp cho cơ quan thuế và bất cứ ngày làm việc nào, không phụ thuộc vào thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của lần tiếp theo, nhưng phải trước khi cơ quan thuế công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế tại trụ sở của người nộp thuế”
Trường hợp cơ sở kinh doanh xuất khẩu đã lập hoá đơn GTGT với số tiền thấp hơn giá trị hàng hoá thực tế xuất khẩu và sau đó cơ sở kinh doanh tự phát hiện được sai sót khi cơ quan thuế, thanh tra thuế tại trụ sở của cơ sở kinh doanh thì cơ sở kinh doanh phải xuất hoá đơn bổ sung và được khai bổ sung hồ sơ khai thuế.