Theo đánh giá của các chuyên gia ngành thủy sản, khả năng thực hiện quy định này ở Việt Nam hiện nay là rất khó. Việt Nam là một quốc gia có nghề cá quy mô nhỏ (131.000 tàu), lực lượng quản lý mỏng, năng lực thống kê và dự báo trong nghề cá còn yếu, doanh nghiệp Việt Nam lại thu mua nguyên liệu qua hệ thống trung gian, do đó, rất khó để thực hiện ghi chép nguồn gốc xuất xứ đầy đủ.
Theo Cục Khai thác và Bảo vệ Nguồn lợi Thủy sản (Bộ NN&PTNT) cho biết, quy định mới này sẽ là một trở ngại lớn cho các doanh nghiệp vì hiện nay nguyên liệu đầu vào cho chế biến xuất khẩu thủy sản luôn thiếu hụt. Bên cạnh đó, để thực hiện đúng theo quy định trên, doanh nghiệp sẽ cần đội ngũ cán bộ chuyên trách và từng bước tiếp cận trực tiếp ngư dân để thu mua nguyên liệu.