Các bộ trưởng cũng thống nhất giải quyết vấn đề liên quan đến thuỷ sản bị đánh bắt kèm (thường bị vứt lại và chết trên biển do quá nhỏ). Nhiều tổ chức môi trường đã đấu tranh trong thời gian dài phản đối việc vứt bỏ thuỷ sản đánh bắt kèm vì theo họ làm như vậy tạo ra lượng rác thải khổng lồ.
Theo thoả thuận đã đạt được, hạn ngạch khai thác cá tuyết sẽ tăng thêm 30% so với hạn ngạch năm 2008. Tuy nhiên, ngư dân khai thác sẽ phải sử dụng lưới hoặc các thiết bị đánh bắt tăng sản lượng cá khai thác, giảm lượng đánh bắt kèm để tránh vứt bỏ rác thải ra biển.
Trong khi đó, hạn ngạch khai thác cá tuyết ở biển Bắc (ngoại trừ vùng biển Celtic phía Nam Ailen) bị cắt giảm 25% theo như đề xuất của Uỷ ban Châu Âu (EC).
Cao Uỷ Nghề cá EU cho rằng các nước đã cố gắng để đạt được nhiều thoả thuận quan trọng trong quản lý nghề ở EU. Một trong số các quyết định đó là duy trì lệnh cấm khai thác cá cơm ở vịnh Biscay trong vòng 4 năm.
Hạn ngạch khai thác cá trích ở vùng biển phía Tây Scotland năm 2009 cũng gảm 20% so với năm 2008. Trong khi đó, EC đề xuất giảm tới 52%
.